はい、以下の2点について違いがございます。
- 取得されるスナップショットの保存期間
- Amazon RDSの自動バックアップ機能により取得されたスナップショットの保持期間は、DBインスタンスに設定されていた「バックアップの保存期間」に依存します（0日～35日）
- Cloud Automatorの「RDS: DBスナップショットを作成」アクションにより取得されたスナップショットは通常明示的に削除しない限り保存されます
- DB インスタンスを削除した際のデフォルトの挙動
- Amazon RDSの自動バックアップ機能により取得されたスナップショットは、削除時に「Retain automated backups 」をチェックしない限り全て削除されます。(「Retain automated backups 」をチェックした場合でも、保持期間は上記の保持期間に依存します。)
- Cloud Automatorの「RDS: DBスナップショットを作成」アクションにより取得されたスナップショットは保存されます。